Еще 22 июня в 3:15 по крепости был открыт ураганный артиллерийский огонь, заставший гарнизон врасплох. В 3:23 начался штурм. К 9 часам утра крепость была окружена. В ночь на 23 июня, отведя войска на внешние валы крепости, немцы начали артобстрел, в перерывах предлагая гарнизону сдаться. Последние 450 защитников Цитадели были пленены 26 июня после подрыва нескольких отсеков кольцевой казармы.
Организованная оборона крепости на этом закончилась, оставались лишь изолированные очаги сопротивления и одиночные бойцы, собиравшиеся в группы. Для устранения последних очагов сопротивления германское верховное командование отдало приказ затопить подвалы крепости водой. 20 июля 1941 года крепость полностью перешла под контроль противника.
Одна из надписей в крепости гласит: «Я умираю, но не сдаюсь. Прощай, Родина. 20/VII-41».
Оборона Брестской крепости стала символом мужества и самопожертвования советских солдат в первый, самый трагический период войны.